Genomzentrum

Heutzutage können DNA-Sequenzierungstechnologien eingesetzt werden, um eine (ständig wachsende) Vielzahl biologischer Probleme in einer Vielfalt von Organismen anzugehen. Dazu gehören, beispielsweise de novo Genomassemblierungen, Metagenomik, Nukleinsäure- und Proteininteraktionen, Chromatinstruktur, Einzelzellanwendungen und vieles mehr.

Das Genomzentrum bietet Beratung beim experimentellen Design und Unterstützung bei der Vorbereitung von Proben für die DNA-Sequenzierung an. Es werden auch Sequenzierungsdienste mit geringem bis mittlerem Durchsatz mit verschiedenen Technologien (Illumina für short-read sequenzierung und Pacific Biosciences für long-read sequenzierung) durchgeführt. Ausserdem wird die Entwicklung neuer Anwendungen und Protokolle unterstützt. Die Einrichtung schult Forscher auch in der Vorbereitung von Libraries, hilft bei der technischen Ausstattung für die Vorbereitung von Libraries und Probenqualitätskontrolle und stellt dafür Laborräume zur Verfügung.

 

Mission

• Unterstützung von Forschenden beim experimentellen Design, Fehlerbehebung und, wenn möglich, bei der Vorbereitung von Libraries für Technologien im Bereich der DNA-Sequenzierung.
• Bereitstellung von DNA-Sequenzierungsdiensten mit verschiedenen Technologien.
• Durchführung von Qualitätskontrollen von Proben und Schulung der Forschenden im Umgang mit Instrumenten zur Qualitätskontrolle.

 

Ausstattung

Library-Vorbereitung und Qualitätskontrolle von Proben

• Femto Pulse (Agilent)
• Bioanalyzer 2100 (Agilent)
• BluePippin (Sage Science)
• Covaris S2 (Covaris)
• Megaruptor V2 (Diagenode)
• Chromium X (10Xgenomics)
• Viaflo 96 (Integra)

Sequenzierungsgeräte

• Sequel II (Pacific Biosciences)
• NextSeq2000 (Illumina)
• MiSeq (Illumina)