Massenspektrometrie

Die Einrichtung für Massenspektrometrie bietet hochmoderne Analysedienstleistungen für Metabolomik, Lipidomik, Proteomik und Metaproteomik an.

Die Massenspektrometrie-Einrichtung unterstütz Forschende vom Versuchsdesign über die Probenanalyse bis hin zur Datenauswertung und bieten sowohl gezielte als auch ungezielte Arbeitsabläufe unter Verwendung modernster hochauflösender und Triple-Quadrupol-Massenspektrometrie-Plattformen an.

Ausstattung

Die Massenspektrometrie ist mit folgenden Analyseplattformen ausgestattet:

impact II (Bruker) – Ultrahochauflösendes Quadrupol-Flugzeit-Massenspektrometer (QTOF), gekoppelt an eine UltiMate 3000 HPLC (Thermo Fisher Scientific) für hochauflösende Metabolomik, Lipidomik und die Analyse kleiner Moleküle.
timsTOF HT (Bruker) – Quadrupol-Flugzeit-Massenspektrometer (QTOF) mit Trapped-Ion-Mobilitätsspektrometrie (TIMS), gekoppelt an einen Vanquish Neo UHPLC (Thermo Fisher Scientific), das hochsensible und durchsatzstarke Analysen für Bottom-up-Proteomik, Metaproteomik, Lipidomik und andere Omics-Anwendungen ermöglicht.
Altis Plus (Thermo Fisher Scientific) – Triple-Quadrupol-Massenspektrometer, gekoppelt an einen Vanquish Flex UHPLC (Thermo Fisher Scientific), optimiert für gezielte quantitative Metabolomik, Lipidomik und Proteomik.

Anwendungen

Die Einrichtung unterstützt ein breites Spektrum an analytischen Arbeitsabläufen, darunter:

Gezielte Metabolomik
Ungezielte Metabolomik
Lipidomik
Metallipidomik
Bottom-up-Proteomik
Metaproteomik

Weitere analytische Arbeitsabläufe können in Zusammenarbeit mit dem Personal der Einrichtung entwickelt werden, um spezifische Forschungsfragen zu beantworten.

Datenanalyse

Die Einrichtung unterstützt die Datenverarbeitung und -auswertung mithilfe etablierter kommerzieller und Open-Source-Software. Zur aktuellen Software gehören:

MetaboScape (Bruker) für Metabolomik und Lipidomik
ProteoScape (Bruker) für Proteomik und Metaproteomik
Compass DataAnalysis (Bruker) für Datenvisualisierung und Strukturaufklärung
Skyline für gezielte quantitative Arbeitsabläufe

Je nach Anwendung und Projektanforderungen stehen weitere kommerzielle und Open-Source-Softwaretools zur Verfügung.