Strukturelle Biologie der mRNA-Lokalisierung
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Einleitung
Die Lokalisierung bestimmter mRNAs an bestimmten Stellen im Zytoplasma spielt eine entscheidende Rolle bei der Entwicklung einer Vielzahl von Organismen. Solche mRNAs werden zu Transportpartikeln zusammengesetzt, die mehrere Kopien der mRNA zusammen mit regulatorischen Proteinen enthalten, die die Bindung an Motorproteine des Zytoskeletts ermöglichen und die mRNAs an ihren endgültigen Ort leiten. Die molekulare Grundlage für den Zusammenbau der Transportpartikel ist nach wie vor eine wichtige, unbeantwortete Frage auf diesem Gebiet. Eines der am besten untersuchten Beispiele für eine mRNP-Komponente, die in der Lage ist, nachgeschaltete Ereignisse im mRNA-Stoffwechsel zu beeinflussen, ist der Exon Junction Complex (EJC), ein wichtiger Regulator der oskaren mRNA-Lokalisierung in Drosophila. Strukturstudien dieses Komplexes haben gezeigt, wie er die mRNA stabil hält und wie Kofaktoren im Zytoplasma dazu beitragen könnten, den Komplex zu zerlegen. Wir sind auch daran interessiert, wie die EJC-Komponenten in den Zellkern zurückgeführt werden, um dort in neue mRNPs eingebaut zu werden. Dieser letzte Aspekt hat uns dazu veranlasst, die relativ großen molekularen Baugruppen der Import-Cargo-Komplexe und ihre Regulierung durch RanGTP zu untersuchen. Unser Ziel ist es, mit biochemischen und strukturellen Methoden die Zwischenzustände im EJC-Zyklus zu untersuchen, um ein mechanistisches Verständnis der Funktionsweise des Systems zu erlangen.